Template: SRS015578_WUGC_scaffold_31117 strand: + 1236-1351 ref: 1233-1351 Variable: SRS015578_WUGC_scaffold_31117 strand: + 1018-1133 alnlen 115 mutations 27 involve-A 27 involve-T 0 1236 ATTACTCAATTAGGCAGTAATTGGAATAATGGTTCTAATGCAGGTAGTTTCTATTGGAATTTGAATAACAGTGTTGGGAATCGTAATCGTAATATCAGCAGTCACTTAGTAAATG ::: ::: :: ::: :: ::::::: :::::::: :::: ::: :::::: ::::: :::: :: : :::::::: ::::: ::::::: :: :: ::: ::: :: ::: 1018 ATTGCTCGGTTGGGCGGTGGTTGGAATTATGGTTCTGATGCGGGTGGTTTCTGTTGGAGTTTGTATGGCGGTGTTGGGGATCGTGGTCGTAATGTCGGCGGTCGCTTGGTGTATG