Color scheme: A-to-N substitutions are highlighted in yellow; other substitutions in gray Template: SRS043701_LANL_scaffold_31205 strand: - 3584-3695 ref: 3575-3696 Variable: SRS043701_LANL_scaffold_31205 strand: - 3811-3922 alnlen 111 mutations 25 involve-A 25 involve-T 0 TGTCACTAAATTAGGTGCTAATTGGAATAATGGCTTGAATACCAGTGCTTTCTATTGGAATCTGAATAATGCTTCTTCTAATCGTAATCGGAATATCAGCAGTCAGTTAGT (Template) TGTCGCTGGATTGGGTGCTAGTTGGGGTGGTGGCTTGGCTGCCGGTGCTTTCTATTGGAGTCTGGGTAGTGCTTCTTCTGTTCGTAGTCGGAGTATCGGCGGTCGGTTGGT (Variable)