Template: SRS057717_LANL_scaffold_6837 strand: + 16520-16643 ref: 16520-16643 Variable: SRS057717_LANL_scaffold_6837 strand: + 16269-16392 alnlen 123 mutations 22 involve-A 22 involve-T 0 16520 TTCGTGTTACTAAATTAGGTGGTAAATGGAATAATGGTACTAAATGTGGTGCATGGTATCTTAATCTGAATAATACCTCCTCTAATCGCAATCGGAATATCAGCAGTCACTTACTATATGTGC :::::::: :: ::: :::::: : :::::: ::::: :::: :::::::: :::: ::::: :::: :: : ::::::::::::::::::::: :::: :: ::: ::: :: ::::::: 16269 TTCGTGTTGCTGTATTGGGTGGTGAGTGGAATGATGGTGCTAAGTGTGGTGCTTGGTGTCTTAGTCTGTATGGTGCCTCCTCTAATCGCAATCGGACTATCGGCGGTCGCTTGCTGTATGTGC