Color scheme: A-to-N substitutions are highlighted in yellow; other substitutions in gray
Template:  SRS057717_LANL_scaffold_6837 strand: + 16520-16643 ref: 16520-16643

Variable:  SRS057717_LANL_scaffold_6837 strand: + 16269-16392 alnlen 123 mutations 22 involve-A 22 involve-T 0

TTCGTGTTACTAAATTAGGTGGTAAATGGAATAATGGTACTAAATGTGGTGCATGGTATCTTAATCTGAATAATACCTCCTCTAATCGCAATCGGAATATCAGCAGTCACTTACTATATGTGC (Template)
TTCGTGTTGCTGTATTGGGTGGTGAGTGGAATGATGGTGCTAAGTGTGGTGCTTGGTGTCTTAGTCTGTATGGTGCCTCCTCTAATCGCAATCGGACTATCGGCGGTCGCTTGCTGTATGTGC (Variable)