Color scheme: A-to-N substitutions are highlighted in yellow; other substitutions in gray Template: SRS065504_LANL_scaffold_46367 strand: - 8817-8940 ref: 8818-8941 Variable: SRS065504_LANL_scaffold_46367 strand: - 9066-9189 alnlen 123 mutations 24 involve-A 24 involve-T 0 TTTCGTGTTACTAAATTAGGTGGTAAATGGAATAATGGTACTAAATGTGGTGCATGGTATCTTAATCTGAATAATACCTCCTCTAATCGCAATCGGAATATCAGCAGTCACTTACTATATGTG (Template) TTTCGTGTTGCTAGATTGGGTGGTGAGTGGATTGATGGTGCTGGTTGTGGTGCGTGGTGTCTTACTCTGAATTATGCCTCCTCTAATCGCTATCGGACTGTCGGCGGTCGCTTGCTGTATGTG (Variable)