Color scheme: A-to-N substitutions are highlighted in yellow; other substitutions in gray
Template:  JQ680369.1 strand: + 3464-3578 ref: 3464-3578

Variable:  JQ680369.1 strand: + 3262-3376 alnlen 114 mutations 15 involve-A 14 involve-T 1

GGTGCCCTTTTGTCTGCTAATGCGAATAATGGTGCGAATGCGGGTTTCGGTTATCTGAATGCGAATAATCGTTCCTCGAATGCGAATGCGAACATTGGGTTCCGCTTTTACCGT (Template)
GGTGCCCTTTTGTCTGCTCATGCGAGTAATGGTGCGGGTGCGGGTTTCGGTTCTCTGGGTGCGTATGTTCGTTCCTCGAATGCGTATGCGTACCTTGGGTTCCGCTTGTGCCGT (Variable)