Color scheme: A-to-N substitutions are highlighted in yellow; other substitutions in gray Template: JQ680362.1 strand: - 4927-5038 ref: 4918-5039 Variable: JQ680362.1 strand: - 5155-5266 alnlen 111 mutations 19 involve-A 19 involve-T 0 TGTCACTAAATTAGGTGCTAATTGGAATAATGGCTTGAATACCAGTGCTTTCTATTGGAATCTGAATAATGCTTCTTCTAATCGTAATCGGAATATCAGCAGTCAGTTAGT (Template) TGTCGCTAGATTGGGTGCTGGTTGGGATTATGGCTTGAATGCCGGTGCTTTCTATTGGGGTCTGTATAATGCTTCTTCTGATCGTTATCGGACTATCGGCGGTCGGTTGGT (Variable)